隨著人類經濟活動的蓬勃發展，環境保護面臨相當嚴峻的考驗，污染及環境品質的惡化，使得生態系統受到許多衝擊，而水域環境生態也無可避免的受到破壞。水域生態系統包括：河川、湖泊、地下水、海洋等等，由於不同水域環境特性的差異，使得每個地方孕育的生態物種相當迥異；例如：河川因流速較快，所以生存在河川水域環境中的生物，多半具有適應急流的特殊型態結構；而湖泊環境特點是水流較為緩慢，湖泊的深水層光線較微弱，因此生物多以異養生物及厭氧性生物為主；海洋佔地球面積的70%，更是生物圈中最為龐大的生態系統，海洋又可分為潮間帶、淺海區及外海區等等，各區域的生物物種特色，隨著水域環境特性的差異也有所不同。

水域環境生態系統是豐富又多元的，生物物種具有適應環境的能力，當環境改變，生物物種會出現許多行為來調適，在一般情況下，生物系統存在著一個不斷在作內部調整的動態平衡狀態；然而，這樣動態的平衡，也是可能會被破壞的，當生態系所承受的外部干擾，超過其生態系自我調節的能力時，生態失調的現象就會隨之出現；對水域環境生態而言，人類開發行為所造成的水污染，就是對此生態系統可能帶來最大的外部干擾。我們都知道水體本身擁有自淨能力，也就是它是具有承受一定限度污染的能力，而造成水體水質污染最主要的原因，就是人類所產生、所供給水體的污染是量多而集中的，污染產生的速度已經超過環境的回復能力。

近年來，各縣市環保局、社會上的環保團體及許多學校，大家開始重視我們週遭的水域環境，例如：逢甲大學愛護水資源社，每年均會不定期舉辦淨溪的活動，相關自發性社團所形成的河川巡守隊，也主動加入愛護水環境的行列，對於水域環境的保護，本來就不該只是相關單位的職責，而應是全民的共識與義務，我們應該對於這片環境、這片土地有更多的關懷，美麗的河川景緻是必須靠我們大家一起努力、一起創造的。